La cour a estimé que le lieutenant-colonel de réserve Omri Borberg avait eu un "comportement indigne" de son rang, selon le communiqué.
Il est passible d'une peine maximale de trois ans de prison ferme.
Son subordonné, un sergent-chef de réserve, a de son côté été reconnu coupable d'usage illégal de son arme et de comportement non conforme à l'éthique de l'armée.
Les sentences seront prononcées ultérieurement.
L'organisation israélienne de défense des droits de l'Homme B'Tselem s'est félicitée de cette décision "importante", "à la fois parce qu'elle rend justice à la victime et constitue un message dissuasif pour les soldats et commandants".
Le 6 août 2008, un autre tribunal militaire avait démis de ses fonctions le lieutenant-colonel Borberg uniquement pour "comportement indigne", un chef d'accusation qui ne comporte ni peine de prison ni inscription, au casier judiciaire.
Dans des images vidéo filmées le 7 juillet 2008 par un villageois de Nilin, en Cisjordanie occupée, on voit le garde-frontière tirer sur la jambe d'un manifestant palestinien, menotté et les yeux bandés.
Le Palestinien, Ashraf Abou Rahma, 27 ans, avait été légèrement blessé à la jambe.
Le village de Nilin accueille chaque semaine des manifestations de protestation contre la barrière de séparation construite par Israël en Cisjordanie, qui la présente comme une "clôture antiterroriste". Les Palestiniens la qualifient de "mur de l'apartheid".


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