Bachir, 71 ans, a été arrêté sans violence dans l'ouest de l'île de Java pour être conduit au siège de la police à Jakarta, a indiqué la source. Il est "soupçonné de lien avec le terrorisme", selon lui.
La police a prévu une conférence de presse lundi après-midi.
Bachir est considéré comme l'un des leaders spirituels de la mouvance islamiste radicale en Indonésie. Il a été présenté comme l'"émir" de la Jemaah Islamiyah (ou "communauté islamique"), un réseau clandestin qui lutte pour la création d'un Etat islamique sur une grande partie de l'Asie du Sud-est, du sud de la Thaïlande au sud des Philippines.
Il avait été emprisonné après l'attentat ayant tué 202 personnes, dont de nombreux étrangers, à Bali en octobre 2002, avant d'être libéré en 2006.
Son interpellation suit l'arrestation de cinq personnes et la saisie d'explosifs ce week-end dans plusieurs lieux de l'ouest de Java durant le week-end.
La police n'a pas précisé les raisons de ces arrestations mais le président indonésien Susilo Bambang Yudhoyono a déclaré samedi qu'un projet d'attentat le visant avait été déjoué, sans donner de détails.
Une vaste offensive anti-terroriste a été lancée en Indonésie ces derniers mois après la découverte en février d'un centre d'entraînement clandestin dans la province d'Aceh, dans le nord de l'île de Sumatra. Une douzaine de suspects, dont l'un des leaders présumés du mouvement, Dulmatin, ont été tués et plusieurs dizaines d'autres interpellés.


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